MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 93958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015564	GCA	2	6	169585	169590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917829
3502	NC_015564	GGCA	2	8	169641	169648	25 %	0 %	50 %	25 %	333917829
3503	NC_015564	CCG	2	6	169712	169717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917829
3504	NC_015564	CTC	2	6	169720	169725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917829
3505	NC_015564	ACG	2	6	169814	169819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917829
3506	NC_015564	CGC	2	6	169830	169835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917829
3507	NC_015564	CGT	2	6	169845	169850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917829
3508	NC_015564	GAT	2	6	169885	169890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917829
3509	NC_015564	CGG	2	6	169896	169901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917829
3510	NC_015564	CGA	2	6	169932	169937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917829
3511	NC_015564	GGGCA	2	10	170081	170090	20 %	0 %	60 %	20 %	333917829
3512	NC_015564	CGC	2	6	170127	170132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917829
3513	NC_015564	ACT	2	6	170174	170179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917829
3514	NC_015564	CGCT	2	8	170194	170201	0 %	25 %	25 %	50 %	333917829
3515	NC_015564	CGA	2	6	170205	170210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917829
3516	NC_015564	CG	3	6	170270	170275	0 %	0 %	50 %	50 %	333917829
3517	NC_015564	GCC	2	6	170284	170289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917829
3518	NC_015564	TGG	2	6	170306	170311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917829
3519	NC_015564	ACG	2	6	170319	170324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917829
3520	NC_015564	CG	3	6	170355	170360	0 %	0 %	50 %	50 %	333917829
3521	NC_015564	ACC	2	6	170382	170387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917829
3522	NC_015564	GCG	2	6	170394	170399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917829
3523	NC_015564	CTG	2	6	170434	170439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917829
3524	NC_015564	CGC	2	6	170584	170589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917830
3525	NC_015564	CTGCGC	2	12	170653	170664	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333917830
3526	NC_015564	TGGA	2	8	170768	170775	25 %	25 %	50 %	0 %	333917830
3527	NC_015564	TCA	2	6	170813	170818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917830
3528	NC_015564	ATC	2	6	170855	170860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917830
3529	NC_015564	GCT	2	6	170886	170891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917830
3530	NC_015564	CGA	2	6	170892	170897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917830
3531	NC_015564	GAT	3	9	170915	170923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917830
3532	NC_015564	GCC	2	6	170942	170947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917830
3533	NC_015564	CTC	2	6	170953	170958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917830
3534	NC_015564	TGG	2	6	171101	171106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917831
3535	NC_015564	GCT	2	6	171163	171168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917831
3536	NC_015564	TGA	2	6	171201	171206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917831
3537	NC_015564	CGC	2	6	171256	171261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917831
3538	NC_015564	C	6	6	171314	171319	0 %	0 %	0 %	100 %	333917831
3539	NC_015564	ATG	2	6	171392	171397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917831
3540	NC_015564	TGA	2	6	171480	171485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917831
3541	NC_015564	AC	3	6	171508	171513	50 %	0 %	0 %	50 %	333917831
3542	NC_015564	CTG	2	6	171525	171530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917831
3543	NC_015564	GCGT	2	8	171581	171588	0 %	25 %	50 %	25 %	333917831
3544	NC_015564	CGC	2	6	171603	171608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917831
3545	NC_015564	TCA	2	6	171648	171653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917831
3546	NC_015564	CA	3	6	171665	171670	50 %	0 %	0 %	50 %	333917831
3547	NC_015564	CA	3	6	171789	171794	50 %	0 %	0 %	50 %	333917831
3548	NC_015564	CGG	2	6	171933	171938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917831
3549	NC_015564	AGG	2	6	171953	171958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917831
3550	NC_015564	TGC	2	6	172329	172334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917832
3551	NC_015564	GCG	2	6	172420	172425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917832
3552	NC_015564	GAC	2	6	172466	172471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917832
3553	NC_015564	GC	3	6	172487	172492	0 %	0 %	50 %	50 %	333917832
3554	NC_015564	CGC	2	6	172497	172502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917832
3555	NC_015564	CG	3	6	172553	172558	0 %	0 %	50 %	50 %	333917832
3556	NC_015564	AGT	2	6	172643	172648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917832
3557	NC_015564	CCG	2	6	172893	172898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917833
3558	NC_015564	CGA	3	9	173293	173301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917834
3559	NC_015564	GGA	2	6	173303	173308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917834
3560	NC_015564	ACGA	2	8	173316	173323	50 %	0 %	25 %	25 %	333917834
3561	NC_015564	AGC	2	6	173337	173342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917834
3562	NC_015564	CAT	2	6	173447	173452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917834
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3564	NC_015564	CGG	2	6	173569	173574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917834
3565	NC_015564	AAG	2	6	173667	173672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917834
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3567	NC_015564	GCA	2	6	173704	173709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917834
3568	NC_015564	GTT	2	6	173780	173785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917834
3569	NC_015564	GCG	2	6	173823	173828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917834
3570	NC_015564	TCC	2	6	173885	173890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917834
3571	NC_015564	CGT	3	9	173926	173934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917834
3572	NC_015564	CTG	2	6	173980	173985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917834
3573	NC_015564	ATG	2	6	174021	174026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917834
3574	NC_015564	GA	3	6	174263	174268	50 %	0 %	50 %	0 %	333917835
3575	NC_015564	GAG	2	6	174337	174342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917835
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3577	NC_015564	GCG	2	6	174388	174393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917835
3578	NC_015564	AG	3	6	174394	174399	50 %	0 %	50 %	0 %	333917835
3579	NC_015564	GCC	2	6	174408	174413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917835
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3581	NC_015564	CGCGG	2	10	174516	174525	0 %	0 %	60 %	40 %	333917835
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3583	NC_015564	GTC	2	6	174575	174580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917835
3584	NC_015564	CG	3	6	174614	174619	0 %	0 %	50 %	50 %	333917835
3585	NC_015564	GA	3	6	174697	174702	50 %	0 %	50 %	0 %	333917835
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3587	NC_015564	GAGAAC	2	12	174753	174764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333917835
3588	NC_015564	CGA	2	6	174896	174901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917835
3589	NC_015564	TCT	2	6	174937	174942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917835
3590	NC_015564	GCG	2	6	174970	174975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917835
3591	NC_015564	CGA	2	6	175198	175203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917836
3592	NC_015564	GTC	2	6	175208	175213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917836
3593	NC_015564	GTGG	2	8	175292	175299	0 %	25 %	75 %	0 %	333917836
3594	NC_015564	TGT	2	6	175300	175305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917836
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3596	NC_015564	GGT	2	6	175330	175335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917836
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3598	NC_015564	TCCC	2	8	175423	175430	0 %	25 %	0 %	75 %	333917836
3599	NC_015564	G	6	6	175604	175609	0 %	0 %	100 %	0 %	333917836
3600	NC_015564	ATC	2	6	175686	175691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917836
3601	NC_015564	GATG	2	8	175693	175700	25 %	25 %	50 %	0 %	333917836
3602	NC_015564	ACG	2	6	175742	175747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917836
3603	NC_015564	TGT	2	6	175803	175808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917836
3604	NC_015564	GT	3	6	175807	175812	0 %	50 %	50 %	0 %	333917836
3605	NC_015564	GGTT	2	8	175908	175915	0 %	50 %	50 %	0 %	333917836
3606	NC_015564	TGA	2	6	175920	175925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917836
3607	NC_015564	GGGT	2	8	175933	175940	0 %	25 %	75 %	0 %	333917836
3608	NC_015564	GCA	2	6	175992	175997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917836
3609	NC_015564	GTC	2	6	176018	176023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917836
3610	NC_015564	AAC	2	6	176030	176035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917836
3611	NC_015564	CGT	2	6	176041	176046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917836
3612	NC_015564	GC	3	6	176049	176054	0 %	0 %	50 %	50 %	333917836
3613	NC_015564	GCAC	2	8	176080	176087	25 %	0 %	25 %	50 %	333917836
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3615	NC_015564	GCA	2	6	176099	176104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917836
3616	NC_015564	GCGTC	2	10	176256	176265	0 %	20 %	40 %	40 %	333917837
3617	NC_015564	TGA	2	6	176302	176307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917837
3618	NC_015564	GC	4	8	176321	176328	0 %	0 %	50 %	50 %	333917837
3619	NC_015564	GCC	3	9	176348	176356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917837
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3621	NC_015564	CCT	2	6	176452	176457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917837
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3980	NC_015564	GCA	2	6	194806	194811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917853
3981	NC_015564	CG	5	10	194843	194852	0 %	0 %	50 %	50 %	333917853
3982	NC_015564	TCG	2	6	194853	194858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917853
3983	NC_015564	GC	3	6	194860	194865	0 %	0 %	50 %	50 %	333917853
3984	NC_015564	CTG	2	6	194876	194881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917853
3985	NC_015564	GAG	2	6	194898	194903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917853
3986	NC_015564	CCG	2	6	194910	194915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917853
3987	NC_015564	TGT	2	6	194929	194934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917853
3988	NC_015564	CGAGGT	2	12	194941	194952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333917853
3989	NC_015564	TGC	2	6	195004	195009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917853
3990	NC_015564	CAG	2	6	195011	195016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917853
3991	NC_015564	GCG	2	6	195027	195032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917853
3992	NC_015564	GCG	2	6	195170	195175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917854
3993	NC_015564	CCG	2	6	195187	195192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917854
3994	NC_015564	GCG	2	6	195224	195229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917854
3995	NC_015564	ACTG	2	8	195281	195288	25 %	25 %	25 %	25 %	333917854
3996	NC_015564	CG	3	6	195331	195336	0 %	0 %	50 %	50 %	333917854
3997	NC_015564	GCG	2	6	195343	195348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917854
3998	NC_015564	GAC	2	6	195458	195463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917854
3999	NC_015564	CG	3	6	195546	195551	0 %	0 %	50 %	50 %	333917854
4000	NC_015564	CAGCG	2	10	195701	195710	20 %	0 %	40 %	40 %	333917855

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